Les sept Mages (Masters) engagés dans la Guerre du Saint Graal ont invoqué leurs Esprits Héroïques (Servants) et vont livrer une lutte sans merci. Seul le plus fort pourra obtenir le Saint Graal et voir son vœu exaucé. Après trois guerres sans vainqueur, le combat est sur le point de reprendre encore une fois...
Dans la ville de Fuyuki, les magiciens se réunissent afin de livrer bataille. Mais l'un d'eux, Kirei Kotomine, semble moins motivé que les autres. En effet, ne pouvant se résigner à son destin, Kirei s'interroge : pourquoi doit-il se battre ?
Cependant, un des adversaires de Kirei, Emiya Kiritsugu, va lui faire oublier ses doutes...