Haruhi Suzumiya n’a aucun intérêt pour les humains ordinaires. En revanche, les Aliens, voyageurs temporels, voyageurs dimensionnels et Espers sont les bienvenus. Pour faciliter les échanges avec le paranormal, Haruhi décide de créer son propre club associatif. Après avoir réquisitionné un local et forcé quelques lycéens à devenir membres, SOS Brigade est né. L’objectif : découvrir tous les mystères du monde et les résoudre !
Une saison 2 avec 14 épisodes supplémentaires a été diffusée en mai 2009. Ces épisodes ont été mélangés avec les premiers, lors d'une rediffusion complète de la saison 1.